В 1957 году после смерти Ага-хана III стал Ага-ханом IV, унаследовав этот титул Имама исмаилитов-низаритов.

В 1957 году Королева Великобритании Елизавета II присвоила ему титул «его высочество», а в 1959 году Шахиншах Ирана Мохаммед Реза Пехлеви — «его королевское высочество».

В 1967 году основал Фонд Ага-хана, в 1976 — учредил премию Ага-хана по сельскому хозяйству, в 1977 — основал институт по исследованию учения исмаилитов и учредил премию Ага-хана по архитектуре. С 1983 года — основатель и президент Университета Ага-хана (Пакистан).

Принц является создателем и спонсором многочисленных благотворительных проектов, осуществляемых во многих странах, в том числе в государствах постсоветской Центральной Азии. Под его руководством действует организация Aga Khan Development Network, в рамках которой функционирует ряд социально-экономических, образовательных и культурных учреждений.

Ага-хан дважды (в 1995 и 1998 годах) посещал Горно-Бадахшанскую автономную область Таджикистана, где почти все коренные жители — исмаилиты. Благодаря ему в Горный Бадахшан направляется обильная гуманитарная помощь, имеющая важнейшее значение для этого региона. В Хороге был создан университет.

Яхтсмен, лыжник, увлекается верховой ездой. В 1960-е гг. первым занялся обустройством Изумрудного побережья Сардинии, которое со временем превратилось в одну из самых фешенебельных курортных зон мира.